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初步鑒定：挑選可疑菌落3～4個(gè)先用志賀菌屬多價(jià)診斷血清作試探性玻片凝集試驗(yàn)。將試探性凝集試驗(yàn)陽性的菌落至少接種2～3支KIA和MIU，經(jīng)35 ℃培養(yǎng)18～24h，凡符合KIA：K/A、產(chǎn)氣-/+、H2S-，MIU：動(dòng)力-、吲哚+/-、尿酶-，并結(jié)合試探性玻片凝集試驗(yàn)陽性結(jié)果可鑒定為志賀菌屬。

與類志賀鄰單胞菌和傷寒沙門菌的鑒別：可用動(dòng)力和氧化酶試驗(yàn)加以鑒別，志賀菌均為陰性，而類志賀鄰單胞菌為陽性。傷寒沙門菌硫化氫和動(dòng)力陽性，能與沙門菌屬因子血清（0多價(jià)A-F群或Vi）凝集而不與志賀菌屬因子血清凝集。