根據(jù)《北京海淀區(qū)關(guān)于自主擇業(yè)軍轉(zhuǎn)干部安置管理暫行規(guī)定》的相關(guān)規(guī)定，自主擇業(yè)軍轉(zhuǎn)干部醫(yī)療保障按照以下規(guī)定進行：
一、未就業(yè)期間的自主擇業(yè)軍轉(zhuǎn)干部
自主擇業(yè)軍隊轉(zhuǎn)業(yè)干部參加北京市海淀區(qū)基本醫(yī)療保險，并享受區(qū)公務(wù)員醫(yī)療補助待遇。其個人繳費部分，以個人退役金為計算基數(shù)，按規(guī)定費率繳納，北京市海淀區(qū)干部就業(yè)指導(dǎo)服務(wù)中心代扣個人繳納部分，連同單位繳費部分統(tǒng)一向海淀區(qū)醫(yī)療保險經(jīng)辦機構(gòu)繳納。
自主擇業(yè)軍隊轉(zhuǎn)業(yè)干部服現(xiàn)役期間的個人醫(yī)療保險基金余額，轉(zhuǎn)入新的基本醫(yī)療保險個人帳戶。
二、就業(yè)之后的自主擇業(yè)軍轉(zhuǎn)干部
被企業(yè)和自收自支事業(yè)單位聘用期間，自主擇業(yè)軍隊轉(zhuǎn)業(yè)干部的醫(yī)療保障均按北京市和所在單位有關(guān)規(guī)定執(zhí)行，并由所在單位按規(guī)定承擔單位繳納部分。
聘用單位和自主擇業(yè)軍隊轉(zhuǎn)業(yè)干部應(yīng)依法參加基本養(yǎng)老保險、失業(yè)保險，按國家和北京市的規(guī)定繳納養(yǎng)老、失業(yè)保險費，并享受相應(yīng)養(yǎng)老、失業(yè)保險待遇，其養(yǎng)老、失業(yè)保險繳納年限從其在當?shù)乩U納保險費之日算起。合同到期未續(xù)簽或解除后，養(yǎng)老、失業(yè)保險依本人自愿接續(xù)，所需費用全部由個人承擔。