質(zhì)量控制、進度控制、信息安全控制和成本控制是信息系統(tǒng)工程監(jiān)理中通常要解決的問題，不過在應(yīng)用軟件開發(fā)中出現(xiàn)的知識產(chǎn)權(quán)保護問題也越來越受到重視，并列入了北京信息安全測評中心組織編著的《信息系統(tǒng)工程監(jiān)理》一書中五大IT監(jiān)理目標之一。北京信息安全測評中心是北京市信息辦授權(quán)的目前一家對北京信息系統(tǒng)工程監(jiān)理企業(yè)進行資質(zhì)認證的機構(gòu)，提出了對質(zhì)量控制、成本控制、進度控制、信息安全控制、知識產(chǎn)權(quán)保護控制問題中的相關(guān)原則。
　　質(zhì)量控制中的原則包括：以施工驗收規(guī)范、工程質(zhì)量驗收及評審標準為依據(jù)，督促承建單位全面實現(xiàn)承建合同約定的質(zhì)量目標；以質(zhì)量預(yù)控為重點，對工程施工全過程實施質(zhì)量控制；對工程項目的系統(tǒng)集成、應(yīng)用系統(tǒng)開發(fā)及培訓(xùn)過程進行全面的質(zhì)量控制，監(jiān)督承建單位的質(zhì)量保證體系落實到位；堅持本工序質(zhì)量不合格或未進行驗收簽認，下一道工序不得施工，以防止質(zhì)量隱患。

　　進度控制的三條原則是：以建設(shè)工程施工合同所約定的工期目標為依據(jù)；在確保工程質(zhì)量和安全的原則下控制工程進度；采用動態(tài)的控制方法對工程進度進行主動控制。

　　成本控制的原則包括：嚴格執(zhí)行承建合同中所確定的合同價、單價和約定的工程款支付方法；在報驗資料不全、與承建合同的約定不符、未經(jīng)質(zhì)量簽認或有違約時，監(jiān)理機構(gòu)不予審核和計量；工程量和工作量的計算應(yīng)符合有關(guān)的計算規(guī)則；處理由于設(shè)計變更、合同變更和違約索賠引起的費用增減時，應(yīng)堅持合理、公正；對有爭議的工程量和工程款，應(yīng)采取協(xié)商的方法確定，在協(xié)商無效時，由總監(jiān)理工程師做出決定；對工程量及工程款的審核應(yīng)在建設(shè)工程施工合同所約定的時限內(nèi)。

　　信息安全控制主要體現(xiàn)在：確保安全需求能真實、準確地反映用戶的需求，能降低信息系統(tǒng)的安全風(fēng)險；確認安全方案能符合有關(guān)國家標準和規(guī)定，并在其中進行優(yōu)選；審核安全工程承建方的資格；對系統(tǒng)承建方進行監(jiān)督、管理，對工程的進度、預(yù)算和質(zhì)量進行控制；組織和審核系統(tǒng)安全的整體測試工作，組織工程的安全驗收工作。

　　知識產(chǎn)權(quán)保護控制則包括：工程文檔的知識產(chǎn)權(quán)保護控制，這因為建設(shè)單位的需求方案中體現(xiàn)了該單位的管理關(guān)鍵技術(shù)和經(jīng)營秘密；外購軟件的知識產(chǎn)權(quán)保護控制：監(jiān)理單位要對建設(shè)單位購買的軟件效用進行檢查，維護工程各方的利益；待開發(fā)軟件的知識產(chǎn)權(quán)保護控制：監(jiān)理機構(gòu)應(yīng)及時提醒建設(shè)單位在承建單位在承建合同中明確規(guī)定雙方的知識產(chǎn)權(quán)歸屬，避免產(chǎn)生不必要的知識產(chǎn)權(quán)糾紛。