竺可楨任浙大校長期間，被誘迫加入國民黨，后又被列名為中央委員。臨近解放，竺可楨拒絕了蔣介石去臺灣的邀請，他潛居上海。上海解放第三天，竺可楨在日記中寫道：“解放軍之來，人民如久旱之望云霓，希望能苦干到底，不要如國民黨之腐化。科學對于建設極為重要，希望共產黨能重視之。”
隨后的現(xiàn)實沒有讓竺可楨失望。剛解放，他就被推上了當時被認為全國科學事業(yè)機關--中國科學院的領導崗位上，擔任了負責自然科學的副院長。
1949年09月，竺可楨在第xx屆中國人民政治協(xié)商會議上第一次見到了*以后，此后又多次受到*的接見和宴請。1961年01月21日下午，包括竺可楨在內的中科院四位科學家受邀，到*懷仁堂給*和劉少奇、周恩來等中央領導人作科學方面的報告。竺可楨主講生物學、地學和農學方面的問題。四位科學家共講四個半小時。*提議今后每月可組織兩次這樣的科學報告，“對大家都有好處”。
1963年8月，在青島休養(yǎng)期間，竺可楨寫就《論我國氣候的幾個特點及其與糧食作物生產的關系》一文。*在國家科委編印的內部刊物《科學研究動態(tài)》274期上讀到此文，立即引起興趣。他決定請竺可楨來談談這個問題。
翌年02月06日，*請竺可楨，還有李四光和錢學森前往*菊香書屋談話。對于這次談話，李四光后來曾回憶：“主席知識淵博，通曉古今中外許多科學的情況，對冰川、氣候等科學問題，了解得透徹入微。在他的臥室里，甚至在他的床上，擺滿了許多經典著作和科學書籍，談到哪兒就隨手翻到哪兒。談的范圍很廣，天南海北，海闊天空。”
竺可楨《論我國氣候的幾個特點及其與糧食生產的關系》一文，分析了光、溫度、降雨對糧食的影響，提出了發(fā)展農業(yè)生產的許多設想。*談到此文時對竺可楨說：“你的文章寫得好啊!我們有個農業(yè)八字憲法，只管地，你的文章管了天，彌補了八字憲法的不足�！�
竺可楨在次日的日記中談到這次談話：“毛主席以為‘水、肥、土、密、保、種、工、管’八字憲法在農業(yè)方面照顧尚有缺點，應加‘光和氣’(日光和氣候)。”談話中*對氣候變化情況的詳細詢問以及對未來氣候發(fā)展趨勢的關注，使竺可楨收到鼓舞，此后幾年潛心于歷史氣候變遷的研究。他決意要在過去研究的基礎上，進一步匯集資料，集以往三四十年的深思，進一步深入研究我國歷史氣候變遷問題。1972年04月17日，竺可楨對《中國近五千年來氣候變遷的初步研究》一文作了最后修改，交《考古學報》發(fā)表。在此后幾個月里，在校稿過程中又進行了一些修改。1972年09月10日，他在日記中寫道：“晚間又重復改了氣候變遷文稿，為最后一次，可稱為畢生之作�！彼煤笤撐墓部×�11種版本，除中文的幾種版本外，尚有英、德、法、日、阿拉伯和世界語文種。這篇無論在思想上還是方法上都具有創(chuàng)新的科學論文一經發(fā)表，便在全世界引起了很大反響。
晚年的竺可楨對*愈加崇敬。而與科學終生結緣的他，更是強烈地感受到了新中國科技事業(yè)的取得的輝煌成就。他深深感受到了新中國取得的巨大進步，認為這種成就的取得要歸功于*的領導。他在1968年02月09日的日記中寫道：“十八年中，毛主席的英明領導，科學技術進步之速，前所未有，大不同于解放以前，現(xiàn)在我們能夠自己制造所需要的儀器，能夠培養(yǎng)高級科技人才，能夠有信心解決一切疑難問題，科學真正在我國落地生根，這是解放以前所夢想不到的，而在十八年內統(tǒng)統(tǒng)做到了”。
1970年03月07日是竺可楨的80歲生日，親身經歷過新舊*的他在日記中提到了，他兄弟姊妹六人，有四人在舊社會不到40歲就去世了，他和一個姊姊活到了80歲，“這是毛主席和共產黨衛(wèi)生政策‘防重于治’之賜。國內鼠疫、傷寒、天花等病幾乎絕跡，這不可不為是世界一個大事�！�
